Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP2AP11388 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP2AP11388 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms