Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C8orf88P0DMB2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms