Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms