Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1RP00736 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1RP00736 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1RP00736 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1RP00736 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1RP00736 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1RP00736 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1RP00736 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1RP00736 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1RP00736 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1RP00736 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1RP00736 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1RP00736 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1RP00736 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1RP00736 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms