Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1AO95602 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms