Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms