Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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KDM4BO94953 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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KDM4BO94953 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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KDM4BO94953 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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KDM4BO94953 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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KDM4BO94953 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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KDM4BO94953 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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KDM4BO94953 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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KDM4BO94953 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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KDM4BO94953 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KDM4BO94953 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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