Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNSO60931 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNSO60931 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNSO60931 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNSO60931 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNSO60931 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms