Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PDE6DO43924 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PDE6DO43924 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PDE6DO43924 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PDE6DO43924 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PDE6DO43924 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PDE6DO43924 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PDE6DO43924 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PDE6DO43924 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PDE6DO43924 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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