Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNFSF14O43557 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms