Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms