Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
E9PBE3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
E9PBE3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
E9PBE3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E9PBE3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
E9PBE3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
E9PBE3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E9PBE3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E9PBE3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E9PBE3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms