Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms