Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HNRNPCL3B7ZW38 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNRNPCL3B7ZW38 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms