Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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