Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF8Q9UPP1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms