Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms