Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms