Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms