Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRAPPC2LQ9UL33 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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