Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYTH4Q9UIA0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms