Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CTNNA3Q9UI47 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms