Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms