Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLKQ9UBT6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms