Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms