Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTR3BQ9P1U1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms