Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO28Q9NVF7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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