Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms