Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK-5Q9HDB9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms