Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms