Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms