Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ19

ANKRD60, Ankyrin repeat domain-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD60Q9BZ19 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD60Q9BZ19 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms