Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HIGD2AQ9BW72 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms