Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf50Q9BV19 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf50Q9BV19 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms