Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR3CQ9BUI4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms