Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MCMBPQ9BTE3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms