Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FYCO1Q9BQS8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FYCO1Q9BQS8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms