Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA1CQ9BQE3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms