Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3GL3Q99963 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms