Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP19Q99542 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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