Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNC2Q96PR1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms