Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C10orf90Q96M02 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C10orf90Q96M02 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C10orf90Q96M02 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C10orf90Q96M02 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C10orf90Q96M02 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C10orf90Q96M02 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C10orf90Q96M02 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C10orf90Q96M02 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms