Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SAMD8Q96LT4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SAMD8Q96LT4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SAMD8Q96LT4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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