Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCZQ96LD1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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