Protein–RNA interactions for Protein: Q96IL0

APOPT1, Apoptogenic protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOPT1Q96IL0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOPT1Q96IL0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms