Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BORCS6Q96GS4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms