Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELP4Q96EB1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms