Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms