Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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GTF3C6Q969F1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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GTF3C6Q969F1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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GTF3C6Q969F1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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GTF3C6Q969F1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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GTF3C6Q969F1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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