Protein–RNA interactions for Protein: Q95460

MR1, Major histocompatibility complex class I-related gene protein, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MR1Q95460 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MR1Q95460 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MR1Q95460 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MR1Q95460 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MR1Q95460 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MR1Q95460 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MR1Q95460 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms